MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium bovis AF2122/97 chromosome

Total Repeats: 108270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002945	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791178
2	NC_002945	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791178
3	NC_002945	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791178
4	NC_002945	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791178
5	NC_002945	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791178
6	NC_002945	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791178
7	NC_002945	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791178
8	NC_002945	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791178
9	NC_002945	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	31791178
10	NC_002945	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791178
11	NC_002945	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791178
12	NC_002945	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791178
13	NC_002945	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31791178
14	NC_002945	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	31791178
15	NC_002945	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791178
16	NC_002945	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	31791178
17	NC_002945	AC	3	6	643	648	50 %	0 %	0 %	50 %	31791178
18	NC_002945	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	31791178
19	NC_002945	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791178
20	NC_002945	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791178
21	NC_002945	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31791178
22	NC_002945	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31791178
23	NC_002945	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	31791178
24	NC_002945	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	31791178
25	NC_002945	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791178
26	NC_002945	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791178
27	NC_002945	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791178
28	NC_002945	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791178
29	NC_002945	GC	3	6	1121	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	31791178
30	NC_002945	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791178
31	NC_002945	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791178
32	NC_002945	CA	3	6	1408	1413	50 %	0 %	0 %	50 %	31791178
33	NC_002945	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791178
34	NC_002945	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_002945	A	7	7	1553	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002945	TC	4	8	1562	1569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_002945	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002945	AC	4	8	1686	1693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_002945	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_002945	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_002945	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_002945	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_002945	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002945	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002945	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_002945	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_002945	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_002945	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	31791179
49	NC_002945	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	31791179
50	NC_002945	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	31791179
51	NC_002945	CGGTGC	2	12	2164	2175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	31791179
52	NC_002945	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791179
53	NC_002945	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791179
54	NC_002945	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791179
55	NC_002945	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791179
56	NC_002945	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791179
57	NC_002945	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31791179
58	NC_002945	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	31791179
59	NC_002945	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791179
60	NC_002945	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791179
61	NC_002945	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791179
62	NC_002945	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791179
63	NC_002945	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791179
64	NC_002945	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791179
65	NC_002945	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	31791179
66	NC_002945	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791179
67	NC_002945	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31791179
68	NC_002945	AC	3	6	2855	2860	50 %	0 %	0 %	50 %	31791179
69	NC_002945	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791179
70	NC_002945	GC	3	6	2932	2937	0 %	0 %	50 %	50 %	31791179
71	NC_002945	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31791179
72	NC_002945	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791179
73	NC_002945	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	31791179
74	NC_002945	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	31791179
75	NC_002945	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791179
76	NC_002945	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	31791179
77	NC_002945	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	31791180
78	NC_002945	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791180
79	NC_002945	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791180
80	NC_002945	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	31791180
81	NC_002945	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791180
82	NC_002945	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791180
83	NC_002945	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31791180
84	NC_002945	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31791180
85	NC_002945	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791180
86	NC_002945	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	31791180
87	NC_002945	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791180
88	NC_002945	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31791180
89	NC_002945	GTG	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791180
90	NC_002945	GT	3	6	3812	3817	0 %	50 %	50 %	0 %	31791180
91	NC_002945	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791180
92	NC_002945	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	31791180
93	NC_002945	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31791180
94	NC_002945	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791180
95	NC_002945	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791180
96	NC_002945	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791180
97	NC_002945	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791180
98	NC_002945	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791180
99	NC_002945	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791180
100	NC_002945	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791180
101	NC_002945	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791180
102	NC_002945	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791180
103	NC_002945	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791180
104	NC_002945	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791180
105	NC_002945	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791180
106	NC_002945	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791181
107	NC_002945	CG	5	10	4542	4551	0 %	0 %	50 %	50 %	31791181
108	NC_002945	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	31791181
109	NC_002945	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791181
110	NC_002945	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791181
111	NC_002945	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791181
112	NC_002945	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791181
113	NC_002945	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791181
114	NC_002945	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791181
115	NC_002945	CG	3	6	4978	4983	0 %	0 %	50 %	50 %	31791181
116	NC_002945	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002945	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31791182
118	NC_002945	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791182
119	NC_002945	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791182
120	NC_002945	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31791182
121	NC_002945	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31791182
122	NC_002945	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791182
123	NC_002945	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791182
124	NC_002945	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791182
125	NC_002945	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791182
126	NC_002945	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	31791182
127	NC_002945	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	31791182
128	NC_002945	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791182
129	NC_002945	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791182
130	NC_002945	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791182
131	NC_002945	CGGCGT	2	12	5602	5613	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	31791182
132	NC_002945	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791182
133	NC_002945	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	31791182
134	NC_002945	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31791182
135	NC_002945	ACGGT	2	10	5747	5756	20 %	20 %	40 %	20 %	31791182
136	NC_002945	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	31791182
137	NC_002945	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31791182
138	NC_002945	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791182
139	NC_002945	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791182
140	NC_002945	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791182
141	NC_002945	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791182
142	NC_002945	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791182
143	NC_002945	GC	3	6	6204	6209	0 %	0 %	50 %	50 %	31791182
144	NC_002945	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791182
145	NC_002945	AAGGAC	2	12	6254	6265	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	31791182
146	NC_002945	AGACCA	2	12	6348	6359	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	31791182
147	NC_002945	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791182
148	NC_002945	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	31791182
149	NC_002945	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31791182
150	NC_002945	GC	3	6	6710	6715	0 %	0 %	50 %	50 %	31791182
151	NC_002945	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31791182
152	NC_002945	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791182
153	NC_002945	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791182
154	NC_002945	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791182
155	NC_002945	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791182
156	NC_002945	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31791182
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158	NC_002945	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31791182
159	NC_002945	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791182
160	NC_002945	GT	3	6	7131	7136	0 %	50 %	50 %	0 %	31791182
161	NC_002945	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791182
162	NC_002945	GCC	4	12	7160	7171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791182
163	NC_002945	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791182
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165	NC_002945	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	31791183
166	NC_002945	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791183
167	NC_002945	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791183
168	NC_002945	CAG	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791183
169	NC_002945	GCAGC	2	10	7373	7382	20 %	0 %	40 %	40 %	31791183
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173	NC_002945	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31791183
174	NC_002945	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791183
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199	NC_002945	CAT	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31791183
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202	NC_002945	CGA	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791183
203	NC_002945	ATC	2	6	8793	8798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31791183
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209	NC_002945	CTT	2	6	8972	8977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31791183
210	NC_002945	CCAC	2	8	8986	8993	25 %	0 %	0 %	75 %	31791183
211	NC_002945	TTC	2	6	9006	9011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31791183
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220	NC_002945	CGA	2	6	9422	9427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791183
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233	NC_002945	CGA	2	6	9770	9775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791183
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235	NC_002945	CGA	3	9	9830	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
236	NC_002945	GAG	2	6	9859	9864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
237	NC_002945	CGC	2	6	10041	10046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31791184
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244	NC_002945	CGCAA	2	10	10323	10332	40 %	0 %	20 %	40 %	31791184
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246	NC_002945	GCG	2	6	10398	10403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791184
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248	NC_002945	TGT	3	9	10530	10538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31791184
249	NC_002945	TTC	2	6	10550	10555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31791184
250	NC_002945	GAT	2	6	10561	10566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31791184
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258	NC_002945	CGG	2	6	10792	10797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31791184
259	NC_002945	TCG	2	6	10862	10867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_002945	TCC	2	6	10947	10952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
261	NC_002945	ACG	2	6	10977	10982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_002945	GGC	2	6	11022	11027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_002945	TCG	2	6	11030	11035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_002945	CCT	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
265	NC_002945	ACCCG	2	10	11279	11288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
266	NC_002945	CGG	2	6	11320	11325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_002945	ACG	2	6	11382	11387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_002945	ACC	2	6	11425	11430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
269	NC_002945	ACC	3	9	11495	11503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
270	NC_002945	GCC	2	6	11532	11537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
271	NC_002945	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
272	NC_002945	CCG	2	6	11637	11642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_002945	CGA	2	6	11694	11699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_002945	ACT	2	6	11741	11746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_002945	CAT	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_002945	GAC	2	6	11863	11868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_002945	GGT	2	6	11902	11907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31791185
278	NC_002945	CGA	2	6	11928	11933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791185
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290	NC_002945	CGG	2	6	12395	12400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_002945	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
292	NC_002945	ACG	2	6	12664	12669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791186
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403	NC_002945	AGC	2	6	17740	17745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31791192
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